純化抗體通常用于直接檢測抗原。此時抗體標記有一個易于鑒定的標記物，用于結合和檢測所研究的抗原。在間接檢測抗原方法中，一抗不被標記，而是用標記的二抗（一種抗免疫球蛋白抗體）來檢測。一般而言，建議使用間接法。因為許多商家能夠提供可靠的標記二抗，用間接法不僅省力，結果同樣可靠。
盡管如此，有幾種方法需要標記的一級抗體。例如，在免疫染色試驗中，需要研究2個或2個以上抗原的相對位置時，常需要純化抗體并用不同標記物標記，這樣能比較它們的相對位置。此時使用間接法不合適。因為間接法是用標記二抗來給未標記的一抗定位。又如，有時一抗需要標記，而該樣本中又有大量無關抗體，它們能干擾對一抗的檢測，此時用間接法也不合適。用鼠源性單抗對鼠組織抗原進行定位時，也會出現(xiàn)這種情況。此時需要純化一抗，并直接按下述方法進行標記。
免疫親和純化是另一種可能需要純化抗體的技術。在這一技術中，抗體共價交聯(lián)到一固相基質(zhì)上，如交連的瓊脂糖或聚丙烯酰胺微球。常用的方法是，先將抗體純化，然后連接到通過化學方法激活而具有結合位點的微球上。此時，抗體的純化對實驗的成功至關重要。
還有一種需要純化抗體的試驗，是從多克隆抗血清中分離抗原特異性抗體。多克隆血清中含有復雜多樣的抗體，它不僅含有針對免疫原產(chǎn)生的抗體，還有血清的全部抗體。出于特定目的的需要，必須將抗原的特異性抗體分離出來。例如使用抗肽抗體時，需要分離出特異性識別肽段的抗體。通過純化能獲得特異性很高的抗體。純化抗體的另一用途是降低本底。幾乎在所有技術中，使用純化抗體都能降低非特異性本底。產(chǎn)生這種效果主要是因為一方面能去除引起實驗誤差的污染蛋白，另一方面能控制實驗中產(chǎn)生陽性信號的抗體量。使用純化抗體不會使本底增加，因此純化抗體可以作為所有免疫化學實驗中降低本底的基本手段。
抗體的純化通常是濃縮抗體的zui簡單方法。任何來源的抗體可以用蛋白A或蛋白G的純化方法來濃縮。
盡管純化抗體的方法較多，建議用蛋白A或蛋白G微球純化法作為zui常用的方法。這種方法效率高，能為常用的實驗方法提供足夠純化的抗體，而且隨著商品化的蛋白A和蛋白G基質(zhì)的出現(xiàn)，能將任何來源的抗體純化。抗體的純化也可采用傳統(tǒng)的色譜法，在某些情況下非常有用。這些方法包括DEAE離子交換色譜法、硫酸銨沉淀法及其他方法。但是用蛋白G或蛋白A親和柱法純化較其他方法簡單，并且純化效果是其他方法的數(shù)倍。因此在所有方法中，我們推薦這種方法。
有一種情況不適于應用蛋白G或蛋白A親和柱純化抗體，即多克隆抗體需要進一步分離，且針對某種特異性抗原的組分需要分離。此時可用抗原結合的親和柱純化抗原特異性抗體。這一特殊的純化方法，將在后面討論。
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