恒遠(yuǎn)報道:中國科技大學(xué)光壽紅教授課題組發(fā)現(xiàn)一系列新的risiRNA(antisense ribosomal siRNA,反義核糖體小干擾核糖核酸)抑制因子,并揭示錯誤的核糖體RNA可以導(dǎo)致合成新的risiRNA,從而維持細(xì)胞內(nèi)核糖體RNA的穩(wěn)態(tài),使生物體得以調(diào)節(jié)自身生長發(fā)育速率以適應(yīng)細(xì)胞內(nèi)基因突變和環(huán)境壓力。
這一研究成果以“Erroneous Ribosomal RNAs Promote the Generation of Antisense Ribosomal siRNA”(錯誤核糖體RNA導(dǎo)致反義核糖體小干擾RNA)為題,公布在PNAS雜志上。
哺乳動物生長細(xì)胞中總RNA(核糖核酸)大約有80%為rRNA(核糖體RNA),另外15%為tRNA(轉(zhuǎn)運(yùn)RNA), 編碼蛋白的mRNA(信使RNA)僅占很小一部分。rRNA作為一類重要非編碼RNA,作為細(xì)胞內(nèi)含量高的RNA組分,同時也是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)翻譯機(jī)器主要組成成分。核糖體RNA的轉(zhuǎn)錄、加工與代謝是由一系列極其復(fù)雜的生物化學(xué)反應(yīng)所組成,同時還需要監(jiān)控和調(diào)節(jié)系統(tǒng),以共同維持細(xì)胞內(nèi)核糖體RNA的穩(wěn)態(tài)。
光壽紅教授課題組長期以線蟲為模式動物,從事非編碼小RNA的表達(dá)與加工相關(guān)研究工作,在重大研究計(jì)劃資助下,曾報道了核酸外切酶發(fā)生突變或者當(dāng)線蟲受到外界環(huán)境脅迫之后,細(xì)胞內(nèi)會大量反義核糖體小干擾risiRNA(Nat. Struct. Mol. Biol. 2017)。在上述研究基礎(chǔ)之上,他們進(jìn)一步利用正向遺傳篩選和反向遺傳篩選,發(fā)現(xiàn)了一系列新的risiRNA抑制因子,并發(fā)現(xiàn)錯誤的核糖體RNA可以導(dǎo)致合成新的risiRNA。
這些研究提示在RNA表達(dá)譜分析中,rRNA相關(guān)序列值得認(rèn)真分析,而不應(yīng)像以往作為實(shí)驗(yàn)過程中的降解產(chǎn)物和垃圾序列而被忽略,或者通過實(shí)驗(yàn)方法被去除掉。
此外,這項(xiàng)研究成果發(fā)現(xiàn)小干擾RNA可以在核仁中通過細(xì)胞核RNA干擾通路調(diào)控pre-rRNA的表達(dá),揭示了一個新的小干擾RNA介導(dǎo)的rRNA表達(dá)和穩(wěn)態(tài)調(diào)控機(jī)制,為核糖體RNA調(diào)控機(jī)制的研究提供了新的視角,同時也為小RNA領(lǐng)域開辟了一個新的研究方向。
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